Selama pelaksanaan pembangunan Jalan Tol Solo - Yogyakarta - YIA Kulon Progo, Pemerintah melalui Kementerian PUPR menyatakan juga sangat memperhatikan serta peduli dengan keberadaan bangunan bersejarah, situs-situs cagar budaya dan purbakala yang tersebar di wilayah Yogyakarta.
Oleh karena itu pihak Kementerian PUPR menyatakan akan turut serta memperhatikan dan melestarikan yang ada di sekitarnya, khususnya garis imaginer yang berada di Yogyakarta (melintasi D.I. Yogyakarta dari Gn. Merapi - Parangkusumo).
Diketahui jalan tol ini nantinya akan terkoneksi dengan jaringan Jalan Tol Trans Jawa melalui akses Colomadu, yang merupakan seksi 1 tersebut.
Keseluruhan, proyek ini memiliki total panjang mencapai 96,67 km dari Kartasura hingga Purworejo. Pengerjaan proyek jalan tol Solo - Jogja dibagi menjadi tiga seksi, yakni:
Seksi 1 Kartasura-Purwomartani, dengan panjang sekitar 42,37 km
Seksi 2 rute Purwomartani-Gamping 23,42 km
Seksi 3 rute dari Gamping-Purworejo dengan panjang 30,77 km
Nantinya sepanjang tol ini akan dibangun sembilan simpang susun (interchange) dan satu persimpangan (junction) di Sleman.