Indigo What Do You See mengikuti perjalanan Zora (Amanda Manopo) menghadapi berbagai kejadian mistis. Saat kecil, Zora memiliki kemampuan indigo yang membuatnya kerap dihantui makhluk gaib. Memasuki usia dewasa, Zora menutup kemampuannya.
Namun, tidak disangka adiknya Ninda (Nicole Rossi) yang mengidap skizofrenia juga indigo. Zora pun kembali menghadapi perjalanan mistis.
Zora mengetahui hal itu dari seorang paranormal bernama Sekar (Sara Wijayanto). Kemampuan indera keenam itu membuat Ninda diincar makhluk-makhluk gaib.***